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    <title>095-03 ディスバイオーシス、微生物代謝物、マイクロバイオーム治療、因果推論</title>
    <ownerName>Integrated Medical Foundations</ownerName>
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    <outline text="ディスバイオーシスと因果推論">
      <outline text="ディスバイオーシスの意味と限界">
        <outline text="疾患に関連する群集変化を指す"/>
        <outline text="普遍的な分類学的定義はない"/>
        <outline text="機能喪失や有害活動の増加"/>
        <outline text="疾患、食事、薬剤、通過、炎症が変える">
          <outline text="関連を自動的に原因としない"/>
        </outline>
      </outline>
      <outline text="標本採取と測定の限界">
        <outline text="便は採取しやすいが脱落管腔内容"/>
        <outline text="時間、保存、酸素、抽出、通過で変わる"/>
        <outline text="相対存在量は絶対数不変でも増える"/>
      </outline>
      <outline text="配列解析と補完的手法">
        <outline text="16Sはマーカー領域を増幅する">
          <outline text="多くは属か概略種が限界"/>
        </outline>
        <outline text="メタゲノムは遺伝子と株を区別する">
          <outline text="死菌も検出し発現を証明しない"/>
        </outline>
        <outline text="培養は生存証明と表現型検査を可能に"/>
        <outline text="定量PCRは探した標的のみ高感度"/>
        <outline text="絶対定量が組成データの誤解を防ぐ"/>
      </outline>
      <outline text="短鎖脂肪酸と胆汁酸">
        <outline text="嫌気性発酵が短鎖脂肪酸を作る">
          <outline text="酪酸は結腸細胞の燃料で免疫も調節"/>
          <outline text="便中濃度は産生から取り込みを引いた値"/>
        </outline>
        <outline text="胆汁酸は肝で抱合され微生物が変換">
          <outline text="抗菌薬は変換を減らしディフィシルを変える"/>
          <outline text="種類と部位で保護的にも傷害性にも"/>
        </outline>
      </outline>
      <outline text="他の代謝物と薬物相互作用">
        <outline text="トリプトファン代謝がインドールを作る"/>
        <outline text="コリン・カルニチンはTMAからTMAOへ">
          <outline text="食事と腎排泄が関連を交絡する"/>
        </outline>
        <outline text="蛋白発酵はアンモニア、フェノール、硫化水素"/>
        <outline text="交差栄養で廃棄物が別種の基質になる"/>
        <outline text="微生物はプロドラッグ活性化と不活化">
          <outline text="反応との関連は重症度や食事も反映"/>
          <outline text="機序には経路分離と曝露変化が要る"/>
        </outline>
      </outline>
      <outline text="炎症とクロストリディオイデス・ディフィシル">
        <outline text="炎症は酸素と電子受容体を増やす">
          <outline text="通性菌がこの条件を利用して増える"/>
          <outline text="元の原因でなく指標かつ増幅因子"/>
        </outline>
        <outline text="ディフィシル感染は生態学的因果の例">
          <outline text="抗菌薬が定着抵抗性を崩す"/>
          <outline text="芽胞発芽、菌増殖、毒素が結腸を傷害"/>
          <outline text="下痢なしの検出は定着かもしれない"/>
        </outline>
      </outline>
      <outline text="マイクロバイオーム治療">
        <outline text="糞便移植は群集機能を回復させる">
          <outline text="選択された再発感染に高い効果"/>
          <outline text="スクリーニングも未知リスクは消せない"/>
          <outline text="この成功は無規制な拡大を正当化しない"/>
        </outline>
        <outline text="プロバイオティクスは株と宿主に特異的">
          <outline text="証拠を別製品へ移せない"/>
        </outline>
        <outline text="プレバイオティクスは選択的利用基質">
          <outline text="繊維は脂肪酸を増やすが膨満も"/>
        </outline>
        <outline text="食事は微生物と宿主へ直接作用する">
          <outline text="短期的分類変化は転帰ではない"/>
        </outline>
        <outline text="精密手段：狭域薬、ファージ、人工細菌">
          <outline text="ファージ治療は範囲、免疫、製造が課題"/>
          <outline text="生態学的置換が意図せぬニッチを作る"/>
        </outline>
      </outline>
      <outline text="研究デザインと因果推論">
        <outline text="関連研究は薬剤、食事、地理に交絡">
          <outline text="回帰でも未測定因子は制御できない"/>
          <outline text="診断前の行動変化が逆因果を生む"/>
        </outline>
        <outline text="縦断研究は順序を示すが因果でない">
          <outline text="前臨床的生理が早期変化を起こす"/>
        </outline>
        <outline text="無作為介入は媒介因子を変えれば強い">
          <outline text="食事や抗菌薬は宿主へも作用する"/>
        </outline>
        <outline text="ノトバイオート動物は可能性を示す">
          <outline text="別宿主でドナー群集は変わる"/>
          <outline text="移植は支持でありヒトの証明でない"/>
        </outline>
        <outline text="メンデルランダム化は雑音と多面発現"/>
        <outline text="分類器は治療や地理で予測し得る"/>
        <outline text="多菌種疾患にコッホの原則は適しにくい">
          <outline text="時間性、用量、実験操作、可逆性を使う"/>
          <outline text="分類が違っても群集機能が原因になる"/>
        </outline>
      </outline>
      <outline text="バイオマーカー、主張、階層">
        <outline text="バイオマーカーには固定手順と外部検証">
          <outline text="標準情報を超える判断改善が必要"/>
          <outline text="性能、比較対象、集団、判定不能を報告"/>
        </outline>
        <outline text="個別化の主張は証拠を超えがち">
          <outline text="唯一最適な群集は存在しない"/>
          <outline text="相対存在量の推奨は正常を医療化"/>
          <outline text="有用性は病原体検出と選択移植で最強"/>
        </outline>
        <outline text="治療は狙う機序を定義する">
          <outline text="患者転帰と安全性で判断する"/>
          <outline text="永久定着なしでも持続的利益はあり得る"/>
        </outline>
        <outline text="因果の階層：測定、関連、順序、再現">
          <outline text="機序を示し操作し転帰を改善する"/>
          <outline text="ディスバイオーシスは仮説で診断でない"/>
        </outline>
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