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    <title>092-02 ヒトの変異、浸透率、複雑形質、集団遺伝学、関連解析</title>
    <ownerName>Integrated Medical Foundations</ownerName>
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    <outline text="ヒト変異、集団遺伝学、関連解析">
      <outline text="変異の種類と頻度">
        <outline text="数百万の変異、大半は中立か小効果"/>
        <outline text="祖先と人種、確率と運命を区別"/>
        <outline text="一塩基、挿入・欠失、コピー数、構造変異"/>
        <outline text="短い縦列反復は不安定に伸長し得る"/>
        <outline text="頻度は人でなく染色体の割合"/>
        <outline text="希少は病原性、頻繁は無害とは限らない">
          <outline text="劣性・遅発性アレルは相当頻度に達し得る"/>
        </outline>
      </outline>
      <outline text="突然変異、浮動、選択">
        <outline text="変異率は塩基文脈や親年齢で異なる">
          <outline text="CpGシトシンは脱アミノ化後に変異"/>
          <outline text="無血縁家系に反復性突然変異"/>
        </outline>
        <outline text="遺伝的浮動は小集団ほど強い">
          <outline text="創始者効果とボトルネックで希少アレル増"/>
          <outline text="創始者変異検査は広い解析の代用不可"/>
        </outline>
        <outline text="負の選択は有害アレルを除く"/>
        <outline text="平衡選択は多様性を保つ">
          <outline text="鎌状ヘテロ接合でマラリア重症化減少"/>
        </outline>
      </outline>
      <outline text="祖先、人種、遺伝子流動">
        <outline text="移住がアレルを集団間で移す"/>
        <outline text="変異は共有、離散した生物学的人種なし"/>
        <outline text="遺伝的祖先は統計的類似性"/>
        <outline text="人種は経験を捉え遺伝型の代用でない"/>
      </outline>
      <outline text="ハーディー・ワインベルグ平衡">
        <outline text="無作為交配、大集団、選択等なし"/>
        <outline text="p二乗、2pq、q二乗"/>
        <outline text="帰無モデルであり現実の主張でない"/>
        <outline text="逸脱は集団構造、近親交配、選択、誤り"/>
        <outline text="保因者頻度はアレル頻度の約二倍">
          <outline text="創始者構造や同類交配で破綻"/>
          <outline text="実測集団データを用いる"/>
        </outline>
      </outline>
      <outline text="連鎖と連鎖不平衡">
        <outline text="近い遺伝子座は一緒に伝わる"/>
        <outline text="組換え率は二分の一を超えない"/>
        <outline text="センチモルガンは塩基対距離と異なる">
          <outline text="性や領域で変わる"/>
        </outline>
        <outline text="ホットスポットがハプロタイプブロック形成"/>
        <outline text="連鎖不平衡は非無作為なアレル関連">
          <outline text="マーカーが未測定原因変異をタグ付け"/>
          <outline text="強さと向きは祖先集団で異なる"/>
          <outline text="ファインマッピングで原因候補集合を絞る"/>
        </outline>
      </outline>
      <outline text="遺伝率と複雑形質">
        <outline text="遺伝率は特定集団・環境の分散割合">
          <outline text="個人の形質の遺伝割合でない"/>
          <outline text="高遺伝率でもフェニルケトン尿症は食事療法"/>
        </outline>
        <outline text="広義は全遺伝分散、狭義は相加効果"/>
        <outline text="双生児・家族研究は仮定に依存"/>
        <outline text="一般的変異は小効果、希少変異は大効果"/>
        <outline text="二値疾患の負荷閾値モデル"/>
        <outline text="家族集積はメンデル遺伝とは限らない"/>
        <outline text="相互作用は統計尺度に依存"/>
        <outline text="遺伝子・環境相関は相互作用を模倣"/>
      </outline>
      <outline text="ゲノムワイド関連解析">
        <outline text="標本と遺伝型の品質管理"/>
        <outline text="多重検定に厳しい有意水準"/>
        <outline text="関連だけでは機序を証明しない"/>
        <outline text="集団層別化が関連を交絡">
          <outline text="主成分と混合モデルは軽減のみ"/>
          <outline text="多様な参加者が移植可能性を改善"/>
        </outline>
        <outline text="オッズ比は絶対リスクでない">
          <outline text="結果が一般的ならリスク比を誇張"/>
        </outline>
        <outline text="勝者の呪いで発見時効果が過大"/>
      </outline>
      <outline text="スコア、操作変数、希少変異">
        <outline text="ポリジェニックスコアは重み付き合計">
          <outline text="集団内の相対リスク層別化"/>
          <outline text="高値は診断でなく低値は除外でない"/>
        </outline>
        <outline text="メンデルランダム化は変異を操作変数に">
          <outline text="多面発現や集団構造が仮定を破る"/>
        </outline>
        <outline text="希少変異は遺伝子・領域単位で集約">
          <outline text="負荷検定は同方向、カーネル法は混在"/>
        </outline>
      </outline>
      <outline text="偏りと解釈の限界">
        <outline text="罹患家系の浸透率は症例選択で過大"/>
        <outline text="バイオバンクは重症小児疾患を過少代表"/>
        <outline text="参加の選択でコライダーバイアス"/>
        <outline text="診療録は記録なしを疾患なしと誤分類"/>
        <outline text="大標本は系統誤差を修復しない"/>
        <outline text="データベース不在は希少性のみ支持"/>
        <outline text="分子的帰結、確率、集団分布の三層"/>
      </outline>
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