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module: 035-02
language: ja
chapter: 35
title: "細菌、ウイルス、真菌、寄生虫、微生物遺伝学"
module_title: "微生物の戦略、生態学的ニッチ、選択下の進化"
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# 微生物の戦略、ニッチ、選択下の進化

## 細胞構築が臨床推論を規定
### 細胞構築が能力と薬物標的を制約
### 真菌はヒトと真核細胞機構を共有
#### 選択毒性の幅が狭い
### ウイルスは段階ごとに異なる標的を示す
### 状態、ニッチ、量、宿主との関係を同定

## 細菌外被と薬物到達
### 細胞壁作用薬は拡張中の構造を弱める
#### 活発な増殖が殺菌に重要
### グラム陽性菌は厚い壁を露出し外膜を欠く
### グラム陰性菌は外膜後方に薄い壁
#### ポリンが流入制限、ポンプと酵素が曝露減少
#### ポリン喪失とベータラクタマーゼで強い耐性
### ミコール酸が透過を遅らせ治療を長期化
### マイコプラズマにベータラクタム薬は無効
### 莢膜は補体沈着と貪食を抑える
#### オプソニン抗体が効率的除去を回復
#### 脾機能欠損で莢膜菌血流感染が危険

## 生理状態、バイオフィルム、感染源制御
### 膿瘍、酸性食胞、壊死骨での遅い増殖
#### 酸素、鉄、酸性度が発現と感受性を変える
### 持続生残細胞は一過性表現型の生存者
#### 保護部位からの再燃
### バイオフィルムは付着、基質、成熟
#### 基質が免疫接近と拡散を制限
#### 抗菌薬は付着貯蔵庫を無菌化できない
### 排液、壊死組織除去、器具除去
### 薬剤変更前に感染源と薬物到達を再評価
### 長期抑制療法は根絶と区別する

## ウイルスの必須課題、向性、安定性
### プラス鎖は直接伝令リボ核酸として働く
### マイナス鎖は依存性ポリメラーゼを持ち込む
### レトロウイルスは組み込みで貯蔵庫を作る
### 向性は受容体の存在だけではない
#### 細胞内因子、温度、到達経路
### 直接傷害、免疫攻撃、血管損傷、全身炎症
### エンベロープウイルスは体外で不安定
### 非エンベロープは汚染表面や糞口経路
### 傾向であり単独で感染対策を決めない

## ウイルス変異と選択
### 突然変異、組換え、再集合
### 変異の多くは中立または有害
### 選択は増殖・伝播する変異を濃縮
### 伝播ボトルネックは少数だけを渡す
### 免疫逃避は別の特性を損ない得る
### 進化に意図はなく弱毒化を保証しない

## 真菌の構造と二形性
### キチンとグルカン壁、エルゴステロール膜
### アゾール、ポリエン、エキノキャンディン
#### 活性は菌種と部位で異なる
### 非無菌検体の酵母は定着の場合がある
#### 血液からの回収は通常重要
### 組織侵入菌糸は疾患を強く証明
### 好中球減少では血管侵入でも炎症が乏しい
### 二形性は体外で糸状菌、吸入後は酵母
#### 地理と曝露歴は微生物学の一部
#### 細胞性免疫障害で長期間後に播種

## 寄生虫の生活環
### マラリアはまず肝細胞、血液期で発熱
#### 休眠肝型が再発を起こす
#### 血液期治療だけでは不完全
### 厚層塗抹は検出、薄層は種と負荷評価
### 蠕虫は閉塞、幼虫移動、失血
### 好酸球増加は組織移動と関連
### 糞線虫は自家感染で数十年持続
#### ステロイドで加速播種と敗血症
#### 免疫療法前に曝露歴を得る
### 住血吸虫卵が肉芽腫と線維化を駆動

## 耐性と抗菌薬治療
### 遺伝可能な変異が選択と伝播に遭遇
### 標的変異、酵素、ポンプ、透過性低下
### 水平伝播で複数機序が共に移動
### 耐性遺伝子型と表現型は同一でない
### 最小発育阻止濃度は根絶を測らない
### 部位、重症度、宿主免疫、曝露歴で選ぶ
### 最も狭い有効治療へ調整
### 期間は感染源制御と臨床反応に合わせる

## 検体、マイクロバイオーム、因果性
### 検体品質は結果の上限を決める
#### 扁平上皮の多い喀痰は下気道を代表しない
### 抗菌薬前の血液培養、治療は遅らせない
### マイクロバイオームは定着抵抗性を与える
### ディスバイオーシスは記述で因果でない
### 存在と病原作用を分ける
#### 部位、量、組織侵入、時期で因果性が高まる
### 検出法、部位、負荷、感受性を報告
### 改善しなければ強い薬へ直行せず再検証