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module: 035-01
language: ja
chapter: 35
title: "細菌、ウイルス、真菌、寄生虫、微生物遺伝学"
module_title: "基礎"
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# 細菌、ウイルス、真菌、寄生虫、微生物遺伝学

## 概説
### 細胞構成、複製、代謝、宿主依存性
#### 診断、伝播、免疫反応、治療を決める
### 細菌は原核、真菌と寄生虫は真核
### 正常微生物叢は定着抵抗性を支える
### 検出は必ずしも原因を示さない

## 細菌の細胞構造
### 核なし、核様体の染色体、プラスミド
### ペプチドグリカン壁は浸透圧破裂を防ぐ
#### 染色性と抗菌薬感受性を決める
### グラム陽性菌は厚く露出した壁とタイコ酸
### グラム陰性菌は内膜と外膜の間の薄い壁
#### 外膜はリポ多糖とポリンを含む
#### リピドAは強力な炎症を誘発
### 抗酸菌は脂質に富む抗酸性外被
### マイコプラズマは細胞壁なく壁作用薬に耐性
### 莢膜は貪食を妨げ付着を助ける
### 線毛は結合とデオキシリボ核酸移送、鞭毛は運動
### 芽胞は熱、乾燥、化学物質に抵抗
### バイオフィルムは増殖、免疫、薬剤浸透を変える

## 細菌の増殖と代謝
### 二分裂はクローン性、遺伝子交換で多様化
### 誘導期、対数増殖期、定常期、死滅期
### 生体内増殖は栄養と酸素で形づくられる
#### 遅い、休眠、バイオフィルム集団は反応が異なる
### 好気性、嫌気性、通性嫌気性、微好気性
### 呼吸は電子伝達系と最終電子受容体
### 発酵は受容体なしで補酵素を再生

## 細菌分類と臨床パターン
### 球菌、桿菌、湾曲菌、らせん菌、分枝状
### 染色、酵素、質量分析、核酸配列で精密化
### 分類は変化し名称だけに依存しない
### 細胞外化膿菌は好中球、膿、膿瘍
### 細胞内細菌には強い細胞性免疫が必要
### 毒素介在性疾患は侵入が少なくても生じる
### 偏性細胞内寄生菌は通常培地で増殖不能

## ウイルス
### カプシドに包まれた核酸、時にエンベロープ
#### リボソームと代謝なく宿主装置を使う
### ゲノムの性質が複製と変異を決める
### 受容体への付着が指向性に影響
### エンベロープは脆弱、非エンベロープは残存
### 持続は潜伏、組み込み、長寿命細胞
#### 免疫変化やストレスで再活性化
### 発癌は慢性炎症、細胞周期、組み込み
### リボ核酸ポリメラーゼは校正機能を欠く
#### 分節型は重複感染中に再集合する
### 進化は病原性の方向を定めない

## 真菌
### 真核生物、キチン壁、エルゴステロール膜
### 酵母は出芽、糸状菌は菌糸、二形性は切替
### 表在性、皮下、全身性風土病真菌
### 日和見真菌は好中球減少やT細胞障害を利用
#### カンジダは定着し脆弱宿主で侵入
#### アスペルギルスはアレルギー、空洞、血管侵襲
### 真核細胞の共有で選択性が難しい
#### 標的はエルゴステロール、壁、核酸、有糸分裂

## 原虫、蠕虫、プリオン
### 原虫は多様な生活環の単細胞
#### シスト型は宿主外で生存
### マラリアは蚊、肝臓、赤血球を循環
### 蠕虫は線虫、条虫、吸虫
#### 多くは増殖せず寄生虫量は曝露を反映
#### 糞線虫は自家感染し免疫抑制で致死的
### 組織内移行は好酸球性炎症を生じる
### 間欠的排出で一回の陰性は不十分
### プリオンは異常折りたたみを鋳型化
#### 不活化に抵抗し潜伏期間が長い

## 微生物ゲノム、変異、遺伝子調節
### 複製エラー、損傷、可動性因子で変異
### 抗菌薬は耐性を作らず選択する
### 水平遺伝子伝播は適応を加速
#### 形質転換は遊離デオキシリボ核酸を取り込む
#### 形質導入はバクテリオファージ経由
#### 接合は細胞接触で移す
#### トランスポゾンとインテグロンが集積
### クオラムセンシングは病原性を調節
### 溶原化変換は毒素遺伝子を追加

## 微生物叢と培養検査・同定
### 常在微生物は病原体と競合する
### 抗菌薬は定着抵抗性を低下させる
### ディスバイオーシスは変化の記述で機序でない
### 検体の質が技術に先立つ
#### 安全なら抗微生物薬投与前に感染部位で採取
#### 表在性スワブは深部感染を反映しない
### 培養は生菌回収、治療後病原体を見逃す
### 核酸増幅は死滅後の残存物も検出
### 配列解析だけで因果関係は確立しない